Vòng chung kết giải Bóng đá Thiếu niên (U13) toàn quốc năm nay có sự tham dự của 16 đội bóng. Các đội bóng được chia thành 4 bảng, mỗi bảng 4 đội. Các đội trong bảng thi đấu vòng tròn một lượt để xếp thứ hạng.
Hai đội xếp nhất nhì mỗi bảng sẽ giành vé vào thi đấu vòng Tứ kết. Từ đó xác định các đội bóng vào bán kết và chung kết.
Tại Bảng A, cả hai trận đấu ở lượt đấu cuối giữa U13 Becamex Bình Dương gặp U13 Sông Lam Nghệ An và U13 Bình Dương thi đấu với U13 PVF đều kết thúc với tỉ số hoà 0-0. Kết quả này giúp đội bóng xứ Nghệ xếp nhất bảng với 7 điểm, cùng với U13 PVF xếp nhì bảng với 4 điểm, giành quyền lọt vào vòng Tứ kết.
Trong khi đó, tại Bảng B, U13 Đà Nẵng xếp nhất bảng với 7 điểm sau chiến thắng 2-0 trước U13 Bà Rịa - Vũng Tàu. Thắng U13 Huế 3-0, U13 Hải Dương giành ngôi nhì bảng với 4 điểm cùng tấm vé đi tiếp vào Tứ kết.
Tại Bảng C, U13 Nam Định lội ngược dòng ấn tượng giành chiến thắng 2-1 trước U13 Hồng Lĩnh Hà Tĩnh ở lượt đấu cuối. Qua đó, xếp nhất bảng với 7 điểm.
U13 Hồng Lĩnh Hà Tĩnh để tuột ngôi đầu bảng, chấp nhận xếp nhì bảng với 6 điểm có được sau 2 chiến thắng trước đó.
U13 Quảng Nam "đè bẹp" U13 Navy Phú Nhuận (TP. Hồ Chí Minh) với tỉ số 8-0 ở lượt trận cuối. Tuy nhiên, đội bóng này chỉ có được 4 điểm sau ba lượt trận, bị loại một cách đáng tiếc.
Ở Bảng D, U13 Hoàng Anh Gia Lai xếp nhất bảng với 7 điểm sau chiến thắng 2-1 trước U13 Hà Nội. Trong khi đó, U13 TP. Hồ Chí Minh đứng nhì bảng với 5 điểm sau chiến thắng tối thiểu 1-0 trước U13 Phú Thọ.
Lượt đấu cuối vòng đấu bảng đã chính thức khép lại. Qua đó, xác định được 8 đội bóng xuất sắc nhất lọt vào vòng Tứ kết.
Tứ kết 1 là cuộc đối đầu giữa U13 Sông Lam Nghệ An và U13 Hồng Lĩnh Hà Tĩnh. Tứ kết 2, U13 Đà Nẵng gặp U13 TP. Hồ Chí Minh. Trận Tứ kết 3 là màn so tài của U13 Nam Định và U13 PVF. Trận Tứ kết 4 là cuộc đấu giữa U13 Hoàng Anh Gia Lai gặp U13 Hải Dương.
Các trận Tứ kết của giải Bóng đá Thiếu niên U13 toàn quốc 2025 sẽ diễn ra vào chiều mai 09/07/2025./.